Het Usui systeem van Natuurlijk Genezen is ontdekt door Mikao Usui.
Mikao Usui was een wijs man, een spiritueel leraar, in Kyoto, Japan. Een student vroeg hem waarom wij mensen niet in staat zijn te helen met onze handen, net als Christus en Boeddha. Deze vraag veranderde de loop van zijn leven op ingrijpende wijze. Mikao Usui besloot de oude talen te gaan studeren om de oude geschriften in hun oorspronkelijke vorm te kunnen bestuderen. Na zeven jaar studie had hij niets ontdekt. Mikao Usui bezocht vervolgens vele kloosters, bestudeerde de geschriften en kwam op een dag een oude monnik tegen. Hij bestudeerde bij deze man de geschriften en leerde zelfs Sanskriet om alles te kunnen lezen. Na jaren van ononderbroken zoeken stuitte hij op een document, geschreven door een onbekende volgeling van Boeddha. Het document bevatte symbolen en verwijzingen naar de genezingen van Boeddha. Hij bestudeerde deze gegevens en kwam tot de conclusie dat hij alles had, behalve de manier om ze te gebruiken. De gevonden kennis en symbolen werkten nog niet voor hem. Ze waren, net als nu zonder een initiatie door de voor jou juiste persoon, krachteloos. De monniken suggereerden toen een oude doch doeltreffende wijze van bezinning: eenentwintig dagen lang mediteren en vasten op de berg Kuramayama. Op de 21e dag wist hij echter nog steeds niets meer dan toen hij de berg beklom.

Op dat moment echter gebeurde er iets. Toen Mikao Usui aan het einde van de dag opstond om de berg af te dalen was hij een gelukkig man. Hij had het contact met de Reiki-stroom verkregen. De eerste Reiki Master was "geboren". Mikao Usui betrok een eenvoudige woning in een armenwijk van Kyoto en begon mensen te behandelen met Reiki. Zijn ideaal was dat alle gebrekkigen zouden genezen, waardoor zij voortaan in hun eigen onderhoud konden voorzien en een menswaardiger leven konden leiden. Dit lukte hem wonderwel goed, hij hielp velen. Een aantal jaren later echter zag hij mensen in de praktijk, op straat, die hij jaren eerder al behandeld had. Hij sprak met deze mensen, vroeg ze vooral waarom ze weer terug gevallen waren in hun oude leefpatroon. Het antwoord verbijsterde hem: ze vonden het zo moeilijk. Het ging in het begin allemaal goed, ze hadden een baan, een huisje, vaak zelfs een partner om het leven mee te delen. Maar het was wel zwaar. Elke dag werken, de huur betalen, schoolgeld, wist hij wel hoe zwaar het leven was? Nu hadden ze die problemen niet meer. Ze bedelden weer, hadden geen huis meer, ze waren weer vrij van al die lasten... Usui heeft op dat moment ontdekt dat Reiki alleen voor je werkt als je er iets voor wilt laten en hij heeft toen een van de moeilijkste beslissingen genomen in zijn leven. Hij wist nu dat ware genezing van binnen kwam, je moest eerst willen, echt willen. Vanaf dat moment vroeg hij geld of een andere gelijkwardige energie-uitwisseling voor zijn behandelingen en cursussen. De praktijk van Mikao Usui groeide en hij had op een gegeven moment heel veel studenten.

Chujiro Hayashi
Chujiro Hayashi was de ijverigste student van de studenten van Usui. Dat was dan ook de man die hij uitkoos om de praktijk over te nemen toen hij overging. Chujiro Hayashi begon een kliniek en leidde een groot aantal therapeuten op. Zijn kliniek groeide uit tot een van de meest vooraanstaande in Tokyo. In 1935 kwam er een vrouw in zijn kliniek, Hawayo Takata genaamd. Een vrouw van wie niemand vermoedde welke taak zij toebedeeld zou krijgen.

Hawayo Takata
Hawayo Takata is geboren op Hawaï. Hawayo Takata leidde een gewoon bestaan. Toen haar man stierf in 1930 veranderde haar leven drastisch. Zij moest alleen voor het gezin zorgen en dat viel haar zwaar. Zij werd ziek. In 1935 besloot zij de overtocht naar Japan te maken en daar een ziekenhuis te zoeken. Zij kwam terecht in een klein particulier ziekenhuis in Tokio. Het onderzoek bracht onder andere galstenen en een tumor aan het licht. Vlak voor de operatie had Hawayo Takata een gevoel van "dit hoeft niet",Het gevoel hield aan. Zij verzamelde al haar moed en vroeg aan een van de medewerkers of er geen andere manier was. Deze vertelde haar over een andere manier. In een kliniek hier dichtbij behandelen ze zonder chirurgie, zo vertelde hij. Nog diezelfde dag lag zij in de Reiki kliniek van dr. Chujiro Hayashi. Een van de eerste vragen die hij haar stelde was: "Heb je haast?" Zij vond het een rare vraag en ze moest er dan ook even over nadenken. Haast? Hoe lang zou de behandeling dan gaan duren? Dagen, weken, maanden, of langer, zei Dr. Hayashi. Zij dacht, en stemde toe. De behandeling kon beginnen. Ze werd dagelijks door meerdere Reiki-therapeuten tegelijk behandeld. Wat haar opviel was dat iedereen dezelfde diagnose stelde zonder ook maar iets te meten en dat ze allemaal van die ongelooflijk warme handen hadden. Ze schijnt zelfs gekeken te hebben in de mouwen van hun kimono's of er iets verborgen was... Naarmate de behandelingen vorderden werd haar interesse steeds groter. Tegen de tijd dat zij genezen was vroeg zij of zij dit ook mocht leren. Dit werd niet gestimuleerd. Alle behandelaars waren Japanners, Reiki was het geheim van Japan. Toch heeft Dr. Hayashi besloten om een uitzondering te maken. Mevrouw Takata kreeg de eerste graad Reiki. Hawayo Takata heeft een periode op de kliniek van dr. Hayashi gewerkt om ervaring op te doen. Later heeft dr. Hayashi haar zelfs toegestaan de tweede graad te volgen. Op gegeven moment heeft zij zich weer gevestigd op Hawaï en opende daar haar Reiki-praktijk. In 1938 werd Hawayo Takata Reiki Master. Twee jaar later, in 1940, nodigde hij haar uit voor een bezoek in Japan. Zijn einde naderde en hij had, in overleg met zijn familie, besloten dat Hawayo Takata zijn opvolgster werd. Na de formele bekrachtiging ging Chujiro Hayashi over.

Takata heeft Reiki verspreid over alle continenten. In het laatste deel van haar leven heeft zij 22 Reiki Masters opgeleid. Op dit moment zijn er ongeveer duizend traditioneel opgeleide Reiki Masters over de hele wereld. In 1985 is Reiki in Nederland geïntroduceerd.